Как создать ярлык запуска скрипта в Ubuntu 16.04
Создаем файл, меняем расширение на .desktop
И помещаем следующий текст в файл изменив свойства 
Exec,Path,Icon

[Desktop Entry]
Version=1.0
Name=Unipro UGENE
Comment=Unipro UGENE is a cross-platform visual environment for DNA and protein sequence analysis.
Exec=/home/samuel/ugene-1.11.5/ugene -ui
Path=/home/samuel/ugene-1.11.5/
Icon=/usr/share/icons/Humanity/apps/32/access.svg
Terminal=false
Type=Application
Categories=Utility;Application;Development;